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<title>Inverted Repeat</title>

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<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading">Inverted Repeat</h1>

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</div>

<div id="mw-content-text" class="mw-body-content mw-content-ltr" lang="de" dir="ltr"><div class="mw-content-ltr mw-parser-output" lang="de" dir="ltr">Ein inverted repeat (engl. für ‚umgekehrte Wiederholung‘) ist eine <a href="Nukleotidsequenz" title="Nukleotidsequenz">Nukleotidsequenz</a> in einer doppelsträngigen <a href="Nukleins%C3%A4ure" class="mw-redirect" title="Nukleinsäure">Nukleinsäure</a>, die sich auf dem anderen Strang in umgekehrter Reihenfolge wiederholt. Aufgrund der <a href="Basenpaarung" class="mw-redirect" title="Basenpaarung">Basenpaarung</a> kommt ein inverted repeat strangabwärts auf demselben Strang revers komplementär vor. Befinden sich die inverted repeats an beiden <a href="Nukleins%C3%A4ure-Nomenklatur" title="Nukleinsäure-Nomenklatur">5'</a>- oder beiden 3'-Enden einer doppelsträngigen Nukleinsäure, werden sie als inverted terminal repeats bezeichnet.

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Eigenschaften">Eigenschaften</h2></div>

Inverted repeats werden von manchen <a href="Viren" title="Viren">Viren</a> wie <a href="Retroviren" title="Retroviren">Retroviren</a> oder das <a href="Adeno-assoziiertes_Virus" class="mw-redirect" title="Adeno-assoziiertes Virus">Adeno-assoziierte Virus</a><a href="#cite_note-1">[1]</a> zur <a href="Insertion_(Genetik)" title="Insertion (Genetik)">Insertion</a> des viralen <a href="Genom" title="Genom">Genoms</a> in das Genom des <a href="Wirt_(Biologie)" title="Wirt (Biologie)">Wirts</a> verwendet. Daneben kommen sie bei <a href="Insertionssequenz" title="Insertionssequenz">Insertionssequenzen</a>, <a href="Transposon" title="Transposon">Transposons</a><a href="#cite_note-2">[2]</a> und <a href="Miniature_Inverted-repeat_Transposable_Element" title="Miniature Inverted-repeat Transposable Element">Miniature Inverted-repeat Transposable Elements</a><a href="#cite_note-3">[3]</a> vor. Weiterhin kommen inverted repeats – allerdings ohne Nukleotide dazwischen – in den <a href="Palindromische_Sequenz" title="Palindromische Sequenz">palindromischen Erkennungssequenzen</a> von <a href="Restriktionsendonuklease" class="mw-redirect" title="Restriktionsendonuklease">Restriktionsendonukleasen</a> des Typs II vor. Teilweise kommen inverted repeats als <a href="Mikrosatellit" title="Mikrosatellit">tandem repeats</a> in mehrfachen Wiederholungen in einer Nukleotidsequenz vor.

Inverted repeats sind oftmals ein Ort für <a href="Rekombination_(Genetik)" title="Rekombination (Genetik)">Rekombination</a>,<a href="#cite_note-4">[4]</a> teilweise durch Ausbildung von <a href="Sekund%C3%A4rstruktur" title="Sekundärstruktur">Sekundärstrukturen</a> wie <a href="Haarnadelstruktur" title="Haarnadelstruktur">Haarnadelstrukturen</a> oder kreuzförmigen Strukturen.<a href="#cite_note-5">[5]</a> Weiterhin sind sie an der <a href="Genamplifikation" class="mw-redirect" title="Genamplifikation">Genamplifikation</a> beteiligt und erhöhen dadurch die <a href="Evolution%C3%A4re_Anpassung" title="Evolutionäre Anpassung">evolutionäre Anpassungsfähigkeit</a>.<a href="#cite_note-6">[6]</a> Gleichzeitig sind sie aber auch eine Quelle für <a href="Mutation" title="Mutation">Mutationen</a>, die in <a href="Gendefekt" class="mw-redirect" title="Gendefekt">Gendefekten</a> resultieren können.<a href="#cite_note-7">[7]</a>

Datenbanken für inverted repeats sind beispielsweise non-B DB,<a href="#cite_note-8">[8]</a><a href="#cite_note-NONB-9">[9]</a> Inverted Repeats Database,<a href="#cite_note-10">[10]</a><a href="#cite_note-11">[11]</a> P-MITE,<a href="#cite_note-12">[12]</a><a href="#cite_note-13">[13]</a> <a href="EMBOSS" title="EMBOSS">EMBOSS</a><a href="#cite_note-EMBOSS-14">[14]</a> und Palindrome Analyser,<a href="#cite_note-15">[15]</a><a href="#cite_note-16">[16]</a>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Beispiel">Beispiel</h2></div>

<dl><dd>5’-TTACGnnnnnnCGTAA-3’</dd>

<dd>3’-AATGCnnnnnnGCATT-5’</dd></dl>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Einzelnachweise">Einzelnachweise</h2></div>

<li id="cite_note-1"><a href="#cite_ref-1">↑</a> D. M. McCarty: Self-complementary AAV vectors; advances and applications. In: Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy. Band 16, Nummer 10, Oktober 2008, S. 1648–1656, <a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1038/mt.2008.171">10.1038/mt.2008.171</a>, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18682697?dopt=Abstract">PMID 18682697</a>.

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<li id="cite_note-2"><a href="#cite_ref-2">↑</a> I. Ammar, Z. Izsvák, Z. Ivics: The Sleeping Beauty transposon toolbox. In: Methods in molecular biology. Band 859, 2012, S. 229–240, <a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1007/978-1-61779-603-6_13">10.1007/978-1-61779-603-6_13</a>, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22367875?dopt=Abstract">PMID 22367875</a>.

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<li id="cite_note-3"><a href="#cite_ref-3">↑</a> I. Fattash, R. Rooke, A. Wong, C. Hui, T. Luu, P. Bhardwaj, G. Yang: Miniature inverted-repeat transposable elements: discovery, distribution, and activity. In: Genome. Band 56, Nummer 9, September 2013, S. 475–486, <a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1139/gen-2012-0174">10.1139/gen-2012-0174</a>, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24168668?dopt=Abstract">PMID 24168668</a>.

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<li id="cite_note-6"><a href="#cite_ref-6">↑</a> C. T. Lin, W. H. Lin, Y. L. Lyu, J. Whang-Peng: Inverted repeats as genetic elements for promoting DNA inverted duplication: implications in gene amplification. In: Nucleic acids research. Band 29, Nummer 17, September 2001, S. 3529–3538, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11522822?dopt=Abstract">PMID 11522822</a>, <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC55881/">PMC 55881</a> (freier Volltext).

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<li id="cite_note-7"><a href="#cite_ref-7">↑</a> J. J. Bissler: DNA inverted repeats and human disease. In: Frontiers in bioscience : a journal and virtual library. Band 3, März 1998, S. d408–d418, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9516381?dopt=Abstract">PMID 9516381</a>.

</li>

/* start https://de.wikipedia.org/ */

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/* end https://de.wikipedia.org/ */

</style><a rel="nofollow" class="external text" href="https://web.archive.org/web/20131113054733/http://nonb.abcc.ncifcrf.gov/apps/site/default">non-B DB</a> (<a href="Webarchivierung#Begrifflichkeiten" title="Webarchivierung">Memento</a> vom 13. November 2013 im <a href="Internet_Archive" title="Internet Archive">Internet Archive</a>)

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<li id="cite_note-NONB-9"><a href="#cite_ref-NONB_9-0">↑</a> R. Z. Cer, D. E. Donohue, U. S. Mudunuri, N. A. Temiz, M. A. Loss, N. J. Starner, G. N. Halusa, N. Volfovsky, M. Yi, B. T. Luke, A. Bacolla, J. R. Collins, R. M. Stephens: Non-B DB v2.0: a database of predicted non-B DNA-forming motifs and its associated tools. In: Nucleic acids research. Band 41, Database issueJanuar 2013, S. D94–D100, <a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1093/nar%2Fgks955">10.1093/nar/gks955</a>, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23125372?dopt=Abstract">PMID 23125372</a>, <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3531222/">PMC 3531222</a> (freier Volltext).

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<li id="cite_note-10"><a href="#cite_ref-10">↑</a> <a rel="nofollow" class="external text" href="https://web.archive.org/web/20200901164938/http://tandem.bu.edu/cgi-bin/irdb/irdb.exe">Inverted Repeats Database</a> (<a href="Webarchivierung#Begrifflichkeiten" title="Webarchivierung">Memento</a> vom 1. September 2020 im <a href="Internet_Archive" title="Internet Archive">Internet Archive</a>)

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<li id="cite_note-11"><a href="#cite_ref-11">↑</a> Y. Gelfand, A. Rodriguez, G. Benson: TRDB–the Tandem Repeats Database. In: Nucleic acids research. Band 35, Database issueJanuar 2007, S. D80–D87, <a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1093/nar%2Fgkl1013">10.1093/nar/gkl1013</a>, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17175540?dopt=Abstract">PMID 17175540</a>, <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1781109/">PMC 1781109</a> (freier Volltext).

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<li id="cite_note-12"><a href="#cite_ref-12">↑</a> <a rel="nofollow" class="external text" href="http://pmite.hzau.edu.cn/django/mite/">P-MITE: a Plant MITE database</a>

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<li id="cite_note-13"><a href="#cite_ref-13">↑</a> J. Chen, Q. Hu, Y. Zhang, C. Lu, H. Kuang: P-MITE: a database for plant miniature inverted-repeat transposable elements. In: Nucleic acids research. Band 42, Database issueJanuar 2014, S. D1176–D1181, <a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1093/nar%2Fgkt1000">10.1093/nar/gkt1000</a>, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24174541?dopt=Abstract">PMID 24174541</a>, <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3964958/">PMC 3964958</a> (freier Volltext).

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<li id="cite_note-EMBOSS-14"><a href="#cite_ref-EMBOSS_14-0">↑</a> P. Rice, I. Longden, A. Bleasby: EMBOSS: the European Molecular Biology Open Software Suite. In: Trends in genetics : TIG. Band 16, Nummer 6, Juni 2000, S. 276–277, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10827456?dopt=Abstract">PMID 10827456</a>.

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<li id="cite_note-15"><a href="#cite_ref-15">↑</a> <a rel="nofollow" class="external text" href="http://bioinformatics.ibp.cz/#/en/palindrome">Palindrome analyser</a>

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<li id="cite_note-16"><a href="#cite_ref-16">↑</a> V. Brázda, J. Kolomazník, J. Lýsek, L. Hároníková, J. Coufal, J. Št'astný: Palindrome analyser - A new web-based server for predicting and evaluating inverted repeats in nucleotide sequences. In: Biochemical and biophysical research communications. Band 478, Nummer 4, 09 2016, S. 1739–1745, <a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2016.09.015">10.1016/j.bbrc.2016.09.015</a>, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27603574?dopt=Abstract">PMID 27603574</a>.

</li>

</ol></div><div><div class="zim-footer">

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